在《自然遗传学》发表的一项新研究中，来自美国农业部农业研究局和博伊斯·汤普森研究所的研究人员绘制了人工种植和野生番茄的基因组。该团队标记了近5000个以前未知的基因，比较了人工种植的西红柿和野生西红柿的基因组，并取得了许多有趣的发现。

2012年，科学家首次对普通栽培番茄的基因组进行了测序。亨氏1706是这次测序的番茄品种。这项新工作将这一观点扩展到所有常规种植的番茄品种及其“近亲”的完整基因组这包括来自725种不同番茄品种的所有基因，在这个过程中，该团队发现了另外4873个基因，这些基因不包括在亨氏1706基因组中。

当比较人工种植的西红柿和野生西红柿时，研究人员注意到我们通常在超市购买的西红柿中缺失了数千个基因。为了以更快的速度获得更多更大的西红柿，种植者似乎已经放弃了他们的口味和其他特征。

该论文的合著者詹姆斯·乔凡诺尼在一份声明中说:“构建这种全基因组的最重要的发现之一是标记为TomLoxC的罕见基因形式，其DNA基因启动子版本大部分是不同的。”。"该基因通过催化许多脂类的生物合成来影响水果的味道——挥发性物质——这些化合物往往会消失."

根据他们自己的测试，研究人员认为只有2%的栽培番茄中发现了味觉相关基因，但超过90%的野生番茄中发现了这种基因。

乔凡诺尼说:“在早期的番茄品种中，似乎有很大的选择压力，或者至少没有选择这个版本的番茄红素。这种形式在现代番茄中越来越受欢迎，这可能反映了育种者对改善口味的新兴趣。”