由于存在方法上的问题，迄今为止对埃及木乃伊基因的研究很少，但最近一个国际研究小组首次成功破译了埃及木乃伊的完整基因组，这将有助于人们进一步研究埃及历史。

埃及位于欧洲、亚洲和非洲三大洲的交汇处，因此它一直是邻近地区人们密切交流的舞台。由德国、英国和波兰科学家组成的研究小组最近在英国杂志《自然通讯》上报道说，他们分析和研究了古埃及人的基因关系，并将其与现代埃及人进行了比较。

研究小组首先从公元前1400年至公元400年的151具木乃伊中提取组织样本，然后成功地重建了90具木乃伊的线粒体基因组和3具木乃伊的全基因组数据。

通过比较基因数据库中的记录，研究人员发现古埃及人的基因最接近当时中东的居民，并且与新石器时代的安纳托利亚半岛人和欧洲人关系密切。在过去的1500年里，南部非洲基因对当代埃及基因的“贡献”逐渐增加。

研究人员解释说，尼罗河沿岸居民流动性的增加，撒哈拉以南非洲和埃及之间频繁的贸易，以及大约1300年前开始的跨撒哈拉奴隶贸易，可能是基因流动的原因。

与此同时，研究人员还发现，在分析古埃及人的遗传连续性时，古埃及人的遗传结构并没有多大变化。这表明古埃及人的基因相对不受外来力量的影响，比如统治埃及的亚历山大大帝。