海水鱼
氮元素在鱼缸中的形态主要是含氮有机物、NH3、N2、NO2-和NO3-。其它的形态主要存在于微生物的体内代谢中，含氮有机物与其他有机物一样，本身没有太多的害处。但是水体中含量高的时候，会影响PH值、引起异养菌大量繁殖、引起蓝绿藻的泛滥等，这都是我们不希望的结果。
而含氮有机物分解后，会带来NH3的增加。所以，鱼缸里都会使用蛋白质分离器把有机物撇除出去，减少含氮有机物的积累。
NH3对生物是有毒害作用的，它进入鱼类的血液后，会影响红血球的携氧能力，导致鱼类供氧不足，鱼会表现出呼吸加快、烦躁不安、昏迷等症状。NH3的毒害作用强弱与PH有关，在酸性环境中，NH3主要以NH4+（铵）的形式存在，不容易透过鱼鳃进入血液，其毒性不强。但在海水的碱性环境中主要是NH3态。NH3的含量超过0.3ppm就会对鱼和珊瑚造成伤害。藻类和珊瑚的虫黄藻可以吸收利用NH3，但是鱼缸中的NH3主要还是由硝化细菌处理成NO3-。 NO2-是NH3未完全氧化（这个过程由亚硝化细菌完成）的产物，它会在硝化细菌的作用下继续氧化，最后变成NO3-。实际测试表明，NO2-对海洋鱼类的毒害作用，比对淡水鱼类的毒害作用小得多。绝大多数海洋鱼类可以耐受很高的NO2-，有些海洋鱼类甚至可以耐受数千ppm的NO2-。
珊瑚也同样如此，这是因为海水中有大量的氯离子，氯离子大大降低了NO2-被鱼吸收的可能性。我们很多人认为NO2-对鱼和珊瑚有很大毒性，基本上是延续了从淡水鱼上获得的认识。当然，对个别种类的海洋鱼，其耐受度确实不高，高于0.3ppm就有可能将其致死，但这种鱼类很少。天然海水中的NO2-不会超过0.2ppm，绝大部分海洋水体的NO2-只有0.001ppm以下的水平。
其实市面有不少测试工具可以验出氨、亚硝酸盐（NO2）和硝酸盐（NO3）。但由于氨会快速地转变为亚硝酸盐（NO2），所以其实也没有必要去检示氨的浓度。但要注意，你必须留意亚硝酸盐（NO2）的浓度，尤其是一个全新的鱼缸；因为通过留意亚硝酸盐（NO2），你可以更加明白氮化合物循环的进展过程。还有一点，若你的鱼缸已经充份发展的话，你的亚硝酸盐（NO2）浓度将会隐定在一个很低浓度。
除氮技术：
1、换水
最直接的方法，但成本高，除了盐钱，还有RO机或购纯净水的费用。而且麻烦，每次换水最好不超过总水量的5%，而且要确保盐已经完全溶解。没有溶解的盐会导致珊瑚烂皮，伤害鱼类腮叶。
2、活石
著名的柏林法就是靠高品质的活石来同时达到硝化和反硝化过程的，效果可以用神奇来形容。缺点的活石较贵，缸中造流要求较强。但基本上没有其他副作用，强烈推荐这一办法。
3、黑白球
一种带有内循环的封闭容器，白球是反硝化细菌的食物，反硝化细菌在容器中消耗NO3，产生氮气，达到反硝化目的。但可以处理的水量较少（每秒1-4滴），有可能会腐败导致翻缸。
4、吸收硝酸盐的海水生物
许多种海洋生物都有吸收硝酸盐的能力，它们利用其中的氮进行复杂的化学合成，形成蛋白质和遗传物质。硝酸盐主要被微生物（如细菌）和完全利用光合作用合成营养物质的藻类、珊瑚和海葵所吸收。