农村土地承包经营权是指农村土地承包人对其依法承包的土地享有占有、使用、收益和一定处分的权利。为便于农村土地承包经营权登记过程中统一掌握政策，那么土地确权纠纷处理有哪些难题呢？接下来小编为您具体介绍。
退耕还林土地的登记
1998年第二轮土地承包后，农户承包土地按相关规定已经退耕还林的，应按林地承包颁发林权证，不再列入这次土地承包经营权确权范围，只在登记簿中登清。
流转承包地的登记
农户之间如果互换、转让以后的承包地，若经营权没有纠纷，应按现占有土地的承包人进行确权登记。对存在纠纷的，先解决纠纷再进行登记转让承包土地，限于集体经济组织内部，对于跨村民小组的承包地互换，双方村民小组经民主协商同意互换的，可按互换后的承包关系登记。双方或一方村民小组不同意互换的，仍按互换前的承包关系登记。对以转包、出租、入股、抵押等方式流转的土地按原承包转出农户登记，不得给受转让颁发土地承包经营权证，其流转关系继续履行原土地流转合同约定。自行开垦耕、自留地、园地本次暂不进行确权登记。
婚嫁后承包地变化登记
在嫁入地未取得承包地的，在其原居住地的承包地不得收回，应按规定登记。
劳务输出农民的承包地登记
不得以农民外出务工经商而影响承包土地登记，对于常年外出未归，未委托代理人又无法联系的外出人员，可按正常情况办理登记，其承包地暂由集体视为机动地代为管理。
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