科学手段也无法对各种菌进行分离，进行规模化生产。因为原料等成本的上升，特别是房租、人力等成本的猛涨，传统制作的臭豆腐往往价格较高，也难以满足一些人“物美价廉”的心里期待，在供求失衡的缺口下，一些黑心商贩开始投机取巧生产粪水臭豆腐，那么怎样区分粪水臭豆腐呢？
一看：臭豆腐的水是否黑得像墨水一样有小颗粒的沉淀则不正常，或者是红褐色有沉淀，它们基本都分层；这些都属于不正常的。
二嗅：闻臭豆腐表面臭味是否刺鼻、恶臭、带有金属味都是异常现象。
三掰：掰开豆腐看一看，里面是否较白味浅，如色差太大、豆腐里面如新鲜豆腐未经发酵过的属于速成臭豆腐。另外，有些小店、小摊是正宗臭豆腐的可能非常小。