砷在自然界中有时会以元素砷的形式存在，但主要还是以三价和五价的有机或无机化合物的形式存在。自然界中常见的三价砷有三氧化二砷也就是砒霜、亚砷酸钠和三氯化砷;五价砷有五氧化二砷、砷酸及其盐类。无机砷在环境中或生物体内可以形成甲基砷化物.它在酸性环境中经金属催化释放新生态氧，并生成砷化氢，具有强毒性。海水中的砷主要以偶砷基甘氨酸三甲丙盐和偶砷基胆碱及偶砷基糖的形式存在。
砷污染对水稻的影响危害极大，研究表明，废渣中的砷经雨水淋滤，浸泡，渗漏进入农田，造成土壤污染而导致水稻减产其至无收，水是砷污染传播的载体。土壤砷污染也是威胁农产品安全以及人类健康的重大问题。由于稻田长期处于淹水还原状态,砷污染的生物有效性相对较高,所以说水稻与其他作物相比更易受砷污染的影响危害。土壤微生物是碳、氮、磷、硫等元素循环和转化的主要推动力,微生物群落结构的变化能敏感地反映土壤生态系统受人为干扰过程中的细微变化,是评价土壤质量的良好指标。
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