中世纪始于公元476年西罗马帝国的灭亡，止于15世纪。这一千年的历史可以大致分为两个部分。在11世纪之前，它通常被称为黑暗时代。在基督教神学和繁琐哲学的教条下，西欧人失去了思想自由，生产僵化，技术进步缓慢，数学停滞不前。自11世纪以来，情况略有改善。
很少有希腊文化通过罗马人传播到中世纪，其中大部分见于伊希斯的作品(约480 ~ 524)。他的《算术原理》基本上是新毕达哥拉斯数学家尼科尔·霍斯的《算术导论》的翻译，但一些精彩的命题被删除了。博伊西斯的“几何”是基于欧几里得的“原始几何”，但根本没有证明，因为他认为证明是多余的。
公元529年，东罗马皇帝查士丁尼下令关闭雅典的学校，并严格禁止数学研究和传播。数学的发展再次受到重创。在接下来的几百年里，只有少数几个著名的数学家，其中大部分是神职人员。
比德自称博学多才，是一位在修道院度过一生的英国僧侣和学者。他的技能是计算复活节的日期(每年春分月圆后的第一个星期天)，并使用手指。后来，阿尔金也是一位著名的英国神学家。大约在781年，他接受了查理曼大帝的邀请，在法兰克王国担任宫廷教师和顾问。他汇编的算术书籍现在似乎相当肤浅。盖尔伯最初是兰斯的大主教，后来被选为教皇，并改名为西尔维斯特二世。他热衷于学术推广，并为促进“四门艺术”(音乐、几何、算术和天文学)的研究做出了贡献。十字军东征(1096 ~ 1291)使欧洲人接触到阿拉伯国家拥有的古代文化宝藏。
他们将大量阿拉伯语书籍翻译成了拉丁语。因此，希腊、印度和阿拉伯人创造的文化，以及中国的四大发明，都传播到了欧洲。意大利位于东西交通的十字路口，逐渐成为一个新的经济和文化中心。
在12和13世纪，斐波那契是欧洲数学的代表人物。他向欧洲人介绍了印度阿拉伯数字和数字位置系统，以及各种算法的商业应用。
中国的盈与亏技巧和《孙子兵法》的不定方程解法也出现在斐波那契的书中。此外，他还有许多原创作品。
法国主教奥尔斯姆在14世纪引入了索引符号和坐标系统的概念，这是从天文和地理经纬度到现代坐标几何的过渡。英格兰大主教布拉德福德·哈丁在算术、几何和力学方面的作品也很有影响力。欧洲第一个系统三角学的作者是雷乔蒙塔努斯。
文艺复兴后，人类摆脱了中世纪思想的精神枷锁，迎来了一个新时代的到来。