急性扁桃体炎的病程一般为5-10天，而慢性扁桃体炎的病程较长。病毒性扁桃体炎是自限性的，可在3-5天内自行痊愈，但细菌性扁桃体炎可能需要抗生素治疗，通常需要7-10天才能痊愈。
扁桃体炎根据不同类型有不同的治疗时间。根据病程，可分为急性扁桃体炎和慢性扁桃体炎。急性扁桃体炎发病很快。经过积极治疗，病程相对较短，可在5-10天内治愈。慢性扁桃体炎可由病程较长的持续性急性扁桃体炎引起。根据病因，可分为病毒性扁桃体炎和细菌性扁桃体炎。病毒性扁桃体炎可在3-5天内自行痊愈，但细菌性扁桃体炎可能需要抗生素治疗，可在积极干预后7-10天内治愈。
不是所有的扁桃体炎都能自行痊愈。发现扁桃体炎后应积极干预，防止疾病反复发展为慢性扁桃体炎，增加治疗难度，并可能影响生活质量。