潜水航空母舰具有多种作战能力。战斗时，你可以浮出水面，迅速释放飞机，投入战斗。巡逻时，它可以潜入水下，用作弹道导弹潜艇。

自20世纪80年代以来，美国提出了潜水航空母舰的概念，即巡航时潜入海底15 ~ 20米，起飞和降落时浮出水面。潜水航母隐蔽性好，不易被敌机或水面舰艇攻击。

一些专家认为潜水是为了避免对方的发现，所以潜水的深度受刚刚从水面露出的潜望镜的影响，所以没必要潜水太深。潜水后，船上的各种雷达和无线电通信天线应该能够伸出水面。并且排水量不应过大，以现代小型航空母舰的尺寸为准；飞行甲板不应太长，垂直短程飞行可以起飞和降落。内置导弹的垂直发射器；使用核动力装置，水下速度可达35节，水面速度可达30节。有人说，难以打破的主要困难是潜水航母的船体密封相当困难。潜水前和漂浮后启动和操作船体的各个部分需要很长时间。防水、防漏和维护总是难以解决所有这些问题。